Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp11Q02853 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms