Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms