Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col6a2Q02788 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms