Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms