Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RykQ01887 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RykQ01887 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RykQ01887 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms