Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mc1rQ01727 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms