Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VegfaQ00731 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms