Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neo1P97798 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms