Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cry1P97784 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms