Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smyd1P97443 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smyd1P97443 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms