Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms