Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp1P97350 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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