Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RptnP97347 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RptnP97347 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RptnP97347 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms