Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rit1P70426 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rit1P70426 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rit1P70426 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rit1P70426 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms