Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tp53bp1P70399 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms