Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbx6P70327 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms