Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tgif1P70284 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms