Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Surf6P70279 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Surf6P70279 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Surf6P70279 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms