Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DccP70211 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DccP70211 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DccP70211 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DccP70211 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DccP70211 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DccP70211 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DccP70211 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DccP70211 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DccP70211 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DccP70211 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms