Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tra2bP62996 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms