Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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