Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms