Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smg6P61406 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg6P61406 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms