Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms