Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps33bP59016 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps33bP59016 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms