Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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