Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf16P58334 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms