Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpdl3bP58242 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms