Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SmoP56726 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SmoP56726 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SmoP56726 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SmoP56726 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SmoP56726 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms