Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lim2P56563 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms