Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrpP56473 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms