Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc4rP56450 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc4rP56450 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms