Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acod1P54987 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Acod1P54987 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms