Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms