Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PctpP53808 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PctpP53808 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PctpP53808 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms