Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox5P52651 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms