Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ClgnP52194 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms