Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Apobec1P51908 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms