Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TubP50586 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TubP50586 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TubP50586 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TubP50586 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TubP50586 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TubP50586 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TubP50586 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TubP50586 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TubP50586 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TubP50586 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TubP50586 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TubP50586 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms