Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms