Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HpdP49429 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HpdP49429 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HpdP49429 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpdP49429 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HpdP49429 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms