Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms