Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms