Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VdrP48281 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VdrP48281 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VdrP48281 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VdrP48281 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms