Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfaP48030 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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