Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TesP47226 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TesP47226 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TesP47226 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TesP47226 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TesP47226 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TesP47226 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TesP47226 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TesP47226 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TesP47226 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TesP47226 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms