Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf1P46099 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms