Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgavP43406 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms