Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlx1P43345 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tlx1P43345 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms