Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LtbP41155 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbP41155 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbP41155 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms